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顯微鏡下受瘧疾寄生蟲感染的紅細(xì)胞
發(fā)布時間:2019/12/9
杜克大學(xué)工程師開發(fā)了一種顯微鏡,它可以調(diào)整其照明角度、顏色和圖案,同時自學(xué)完成給定診斷任務(wù)所需的最佳設(shè)置。在最初的概念驗證研究中,顯微鏡同時開發(fā)了照明模式和分類系統(tǒng),使其能夠比訓(xùn)練有素的醫(yī)生和其他機器學(xué)習(xí)方法更準(zhǔn)確地快速識別受瘧疾寄生蟲感染的紅細(xì)胞。其研究結(jié)果發(fā)表在《生物醫(yī)學(xué)光學(xué)快報》期刊上。杜克大學(xué)生物醫(yī)學(xué)工程助理教授Roarke Horstmeyer說:標(biāo)準(zhǔn)顯微鏡用來自四面八方相同數(shù)量的光照射樣本,數(shù)百年來,照明一直為人眼優(yōu)化。
但是計算機可以看到人類看不到的東西,因此不僅重新設(shè)計了硬件,提供了多種照明選擇,還允許顯微鏡為自己優(yōu)化照明。工程師們沒有從下方擴(kuò)散白光來均勻地照亮幻燈片,而是開發(fā)了一種碗狀光源,整個表面都嵌入了LED。這使得樣品可以用不同的顏色從不同角度照明到近90度,這實際上根據(jù)使用的LED圖案投射了樣品陰影和高亮顯示不同的特征。然后,研究人員向顯微鏡放入數(shù)百個瘧疾感染的紅細(xì)胞樣本,這些樣本作為薄涂片制備。
其中細(xì)胞體保持完整,理想情況下在顯微鏡載玻片上展開為單層,使用一種稱為卷積神經(jīng)網(wǎng)絡(luò)的機器學(xué)習(xí)算法,顯微鏡學(xué)習(xí)樣本的哪些特征對于診斷瘧疾最重要,以及如何最好地突出這些特征。該算法最終落在來自相對較高角度不同顏色的環(huán)形LED圖案上,雖然產(chǎn)生的圖像比普通顯微鏡圖像更嘈雜,但它們在亮點中突出瘧疾寄生蟲,并且在大約90%的時間內(nèi)被正確分類。受過訓(xùn)練的醫(yī)生和其他機器學(xué)習(xí)算法通常以大約75%的準(zhǔn)確率執(zhí)行。
它挑選的圖案是環(huán)形的,具有不同顏色,這些顏色不均勻,不一定很明顯。盡管這些圖像比臨床醫(yī)生創(chuàng)建的圖像更暗、更吵,但算法說它會忍受噪音,它真的只是想讓寄生蟲高亮顯示,以幫助它做出診斷。然后將LED圖案和分類算法發(fā)送到另一位合作者的實驗室,以查看結(jié)果是否可翻譯到不同的顯微鏡設(shè)置,另一個實驗室也顯示出類似的成功。醫(yī)生必須檢查一千個細(xì)胞才能找到一種瘧疾寄生蟲,而且因為他們必須放大到如此近的距離,一次只能看十幾個,所以大約需要10分鐘。
如果只需要看顯微鏡在幾秒鐘內(nèi)就已經(jīng)挑選出來的少數(shù)細(xì)胞,這將大大加快這個過程。顯微鏡適用于厚厚的血液涂片準(zhǔn)備,其中紅細(xì)胞形成高度不均勻的背景,可能會被分解。對于這個準(zhǔn)備,機器學(xué)習(xí)算法99%的時間是成功的。準(zhǔn)確度提高是可望的,因為測試的厚涂片比薄涂片染色更重,顯示出更高的對比度。但也需要更長的準(zhǔn)備時間,而且該項目是在資源匱乏的環(huán)境中減少診斷時間,在那里,訓(xùn)練有素的醫(yī)生很稀少,瓶頸是常態(tài)。有了這個初步的成功,研究人員正在繼續(xù)開發(fā)顯微鏡和機器學(xué)習(xí)算法
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